"15 Latvijas pilsētu notekūdeņu metagenoma taksonomiskais un funkcionālais raksturojums"

Simple item page
dc.contributor.advisorGudrā, Dita
dc.contributor.authorUstinova, Maija
dc.contributor.otherLatvijas Universitāte. Bioloģijas fakultāte
dc.date.accessioned2021-06-25T01:02:25Z
dc.date.available2021-06-25T01:02:25Z
dc.date.issued2021
dc.description.abstractNeattīrīti notekūdeņi ir ķīmiski un bioloģiski kompleksa vide, taču tā mikrobioloģiskais sastāvs līdz šim ir maz pētīts. Izmantojot šobrīd pieejamās sekvencēšanas un bioinformātikas tehnoloģijas, ir iespējams raksturot notekūdeņu mikroorganismu kopienas sastāvu dažādos līmeņos. Bakalaura darba mērķis bija taksonomiski un funkcionāli raksturot 15 Latvijas pilsētu notekūdeņu metagenomus. DNS tika izdalīta no neattīrītu, 24 h periodā ievāktu koncentrētu notekūdeņu paraugiem, un tai, izmantojot lielapjoma paralēlo sekvencēšanu, tika veikta visa metagenoma analīze. Datu analīzes rezultātā tika noskaidrots, ka pilsētu notekūdeņu metagenomos ir saskatāmas līdzības sugu, ģints, tipa un gēnu līmeņos, taču būtiskas taksonomiskas un funkcionālas metagenoma kompozīcijas atšķirības tika konstatētas starp pilsētām un atšķirīgiem ražošanas notekūdeņu pieplūdumiem.
dc.description.abstractUntreated wastewater is a chemically and biologically complex environment, but thus far its microbiological composition has been little studied. Currently available sequencing and bioinformatics technologies have enabled characterization of the wastewater microorganism population at different levels. The aim of the study was to taxonomically and functionally characterize the wastewater metagenome of 15 Latvian cities. Untreated 24 hour composite wastewater samples were collected at the wastewater treatment plant. Subsequently, DNA was extracted and whole metagenome sequencing analysis was carried employing massive parallel sequencing technologies. Acquired data showed that there are significant taxonomic and functional differences in the composition of the metagenome between cities and different inflows of industrial water, but some similarities at species, genus, phylum and gene levels were also observed.
dc.identifier.other82437
dc.identifier.urihttps://dspace.lu.lv/dspace/handle/7/54445
dc.language.isolav
dc.publisherLatvijas Universitāte
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectBioloģija
dc.subjectnotekūdeņi
dc.subjectlielapjoma sekvencēšana
dc.subjectmetagenoms
dc.subjecttaksonomiskā analīze
dc.subjectfunkcionālā analīze
dc.title"15 Latvijas pilsētu notekūdeņu metagenoma taksonomiskais un funkcionālais raksturojums"
dc.title.alternative"Taxonomical and functional characterization of wastewater metagenomes of 15 cities of Latvia"
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis
Files
Collections
Bakalaura un maģistra darbi (BF) / Bachelor's and Master's theses