Bioloģijas fakultāte / Faculty of Biology

Permanent URI for this community

Now showing 1 - 1 of 1

Smiltsērkšķu marafivīrusa kodēto proteīnu klonēšana, ekspresija un raksturošana
(Latvijas Universitāte, 2022) Ludviga, Rebeka; Baļķe, Ina; Latvijas Universitāte. Bioloģijas fakultāte
Smiltsērķšu marafivīruss (SBuMV) ir iepriekš neraksturots, smiltsērkšķus inficējošs vīruss. Tam ir divas atklātās translācijas fāzes (ORF), kur ORF1 kodē poliproteīnu, kas satur četrus proteīnu domēnus, bet ORF2 kodē apvalka proteīnu (CP). Šajā darbā tika izveidotas ekspresijas plazmīdas SBuMV kodētajiem proteīniem, taču E. coli sistēmā izdevās ekspresēt un attīrīt tikai abas CP formas un proteāzes (PRO) domēnu. Tika pārbaudīta PRO aktivitāte, PRO šķelšanas saits un verificēta PRO deubikvitināzes (DUB) aktivitāte. SBuMV mažorais CP E. coli spēj pašsavākties vīrusam līdzīgajās daļinās (VLP), bet minorais CP veido agregātus. Koekspresijas rezultātā, ja abas CP formas ekspresē no vienas plazmīdas, VLP pašsavākšanās ir traucēta, bet, ja abas CP formas ekspresē no dažādām plazmīdām, tad VLP veidošanās tiek ietekmēta minimāli. PRO un CP tika kristalizēti, taču neizdevās iegūt 3D struktūras. Tādēļ tās tika vizualizētas, izmantojot AlphaFold 2.0 programmu.